Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pax8Q00288 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms