Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Bop1P97452 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Bop1P97452 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Bop1P97452 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Bop1P97452 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bop1P97452 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Bop1P97452 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Bop1P97452 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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