Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NyxP83503 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NyxP83503 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NyxP83503 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NyxP83503 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms