Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx2P80206 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx2P80206 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx2P80206 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms