Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CiitaP79621 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms