Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms