Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx3P70354 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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