Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NfixP70257 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NfixP70257 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NfixP70257 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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NfixP70257 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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NfixP70257 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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NfixP70257 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NfixP70257 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NfixP70257 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms