Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chl1P70232 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms