Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms