Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pcsk1P63239 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcsk1P63239 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcsk1P63239 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Pcsk1P63239 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pcsk1P63239 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms