Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp1P60335 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp1P60335 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms