Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarf2P59222 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarf2P59222 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarf2P59222 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarf2P59222 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarf2P59222 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarf2P59222 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarf2P59222 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarf2P59222 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarf2P59222 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms