Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm2P58774 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms