Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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P58686 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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P58686 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P58686 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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P58686 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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P58686 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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P58686 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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P58686 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P58686 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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P58686 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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P58686 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P58686 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P58686 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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P58686 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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P58686 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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P58686 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P58686 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P58686 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P58686 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P58686 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P58686 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P58686 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P58686 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P58686 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms