Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace1P56818 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms