Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gp1bbP56400 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gp1bbP56400 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms