Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp5P56399 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms