Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms