Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3bp1P55194 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms