Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms