Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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