Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms