Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnfP51944 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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