Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RoraP51448 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RoraP51448 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RoraP51448 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RoraP51448 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms