Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt2P50752 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms