Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa8P50706 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa8P50706 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa8P50706 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa8P50706 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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