Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms