Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BckdhaP50136 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BckdhaP50136 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BckdhaP50136 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BckdhaP50136 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BckdhaP50136 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
BckdhaP50136 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
BckdhaP50136 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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