Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms