Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms