Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd4P46935 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms