Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tulp2P46686 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms