Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mmp9P41245 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mmp9P41245 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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