Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms