Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ly6dP35459 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ly6dP35459 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ly6dP35459 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ly6dP35459 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms