Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms