Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms