Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc11P31313 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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