Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms