Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pabpc1P29341 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pabpc1P29341 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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