Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kif5cP28738 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms