Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CebpbP28033 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CebpbP28033 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms