Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pde6aP27664 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms