Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna1P26231 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnna1P26231 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms