Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms