Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms