Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RarbP22605 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RarbP22605 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RarbP22605 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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