Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms