Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
P20040 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
P20040 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
P20040 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
P20040 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
P20040 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P20040 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms